BSA性状定位，针对目标性状，选取表型差异的亲本构建家系，并采用混池分组分析法(Bulk Segregant Analysis，BSA)进行性状定位。通过对表型子代分别构建的两个样本池及亲本进行测序，检测与目标性状相关的遗传变异，并进行功能注释，从而解析控制该性状的关键基因及其调控机制。
GWAS，基于全基因组重测序技术，通过对自然群体或种质资源中的个体进行基因组测序，并结合目标性状的表型数据，利用统计模型分析基因型与表型之间的关联，挖掘控制目标性状的关键基因或染色体区段。GWAS无需构建特定的群体，能够解析复杂性状的遗传基础，特别适用于多基因控制性状的研究。该方法因其“遗传背景丰富、变异检测、适用性广泛”的优势，已广泛应用于作物改良、动物育种及人类疾病研究。
1. LncRNAs测序，LncRNA（Long non-coding RNAs）是一类长度大于200nt但不编码蛋白质，二代基因测序，广泛存在于动植物中，具有很强的细胞或组织特异性的RNA分子。IncRNA测序可一次性获取样本中几乎全部的IncRNA信息，对IncRNA的类别、功能进行的深入分析，从而快速准确的获得与特定生物学过程相关的IncRNA信息。主要应用于动植物生长发育调控、研究病理发生调控机制、开发潜在生物标记和靶向位点，动植物IncRNA图谱。
1. 空间全长转录组，空间全长转录组是指使用三代ONT测序技术直接读取Stereo-Seq或10X Visium处理获得的、具有空间位置条形码的全长CDNA，通过分析获得每个spot位点的isoform定量结果和可变剪切事件。它不仅能够确定细胞中所有RNA分子的完整序列，而且还能保留这些转录本在组织切片中的原始位置信息。对于理解基因表达的空间分布、细胞间的相互作用以及不同组织区域内的细胞异质性具有重要意义。
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