定期清洗船舶燃油舱安全有效的方法是安排船舶进坞检查和清洗，短期内安排所有正在使用HSFO的船舶进船坞清洗燃油舱并不现实。建议会员船东还应尽早安排船舶油舱清洁的各项工作，以满足即将到来的2020限硫新标准。目前大多数船舶使用的仍是高粘度高硫燃料油(HSFO)，此类燃料油会粘附在油舱内壁上，非常难清洁。
限硫令生效后，船舶油舱清洗，预计大多数船舶将使用含硫量低于0.50%的馏分燃料，油舱清洗泵，但是目前大部分船舶一直在使用高粘度高硫燃料油。提前预约船舶坞期，并应考虑船坞繁忙可能存在的压港现象；慎重安排船员自行清洗，油舱清洗，应考虑到船员人手不足、疲劳、通风不足和安全问题。清洗方法所用时间是基于航运实践的经验总结，柴油舱清洗，并不一定适用于每一船舶。IMO也表示，船舶为满足0.50%m/m含硫量上限而备舱所需的时间和工作量难以预估。
一些航运公司在更换使用燃油舱之前会使用化学添加剂进行清洗。实践证明，这是减少清洗油舱非常有效和经济的方式之一。指南中重要的一个技术环节就是关于船舶在开始使用含硫量低于0.50%m/m的合规燃油前的燃油舱清洗问题。冲洗船舱的灰土、船舱垫尘、油污等产生的废水，该类废水属于含油废水或含有一定毒性液体的污水。
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