提前预约船舶坞期，并应考虑船坞繁忙可能存在的压港现象；慎重安排船员自行清洗，应考虑到船员人手不足、疲劳、通风不足和安全问题。如果由船员来进行油舱清洗，则每个油舱至少需要4天，邮轮清洗工，考虑到不确定因素，宣城邮轮清洗，每个舱好计划预留一周时间。船东需要考虑使用其他的替代方法进行燃油舱和管路的清洗。目前除了进船坞清洗外，还有在营运期间清洗及使用添加剂进行清洗两种办法。
在2015年，IMO实行排放控制区（ECA）内使用0.10%m/m含硫量上限的规则生效后，清洗邮轮甲板，已经有很多船舶采用添加剂的方式清洗燃油舱成功的案例。如果船舶在船坞中仅仅清洗了燃油舱，而没有进行管路冲洗，船舶在接收完合规燃油后仍需要2-5天的时间来冲洗燃油系统管路以达到排放要求。指南中重要的一个技术环节就是关于船舶在开始使用含硫量低于0.50%m/m的合规燃油前的燃油舱清洗问题。
定期清洗船舶燃油舱安全有效的方法是安排船舶进坞检查和清洗，短期内安排所有正在使用HSFO的船舶进船坞清洗燃油舱并不现实。如果雇佣工程队轮流清洗，邮轮清洗底部，则每个油舱至少需要2天，同样为周全考虑，好为每个油舱预留出4天时间。形成含有沉淀物和沥青质污泥的半固态物质层，还会沉淀在燃油管路及沉淀柜和日用柜中。
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