在清洁车间食品工厂的选址、设计、布局、建设和改造中，应尽量避免污染源、交叉污染、混搭和差错。工厂环境干净整洁，人和物流合理。采取适当的门禁措施，防止未经授权的人员进入。保存施工和竣工数据生产过程中空气污染严重的建筑物，应建在厂区的下风侧，全年风向多。相互影响的生产工艺不宜设置在同一建筑内时，医院强弱电安装，应在各生产区域之间采取有效的隔离措施。发酵产物的生产应设有专门的发酵车间。
十万级无尘车间通常都需频繁擦拭，除了用水擦拭还会用消毒水、酒精、其它溶剂等擦拭，这些液体通常都有一定的化学品性，会使一些材料表面变色、脱落，这就要在装修材料上面有一定的耐化学品性。5、生物无尘车间如手术室为了杀菌的需要，通常会安装三氧O3发生器，O3（即臭氧）是一种强氧化气体，会加速环境中物体特别是金属的氧化锈蚀，也会使一般涂层表面由于氧化而褪色，变色，所以此类无尘车间要求其装修材料有很好的耐氧化性。
空气风淋室安装时，根据设计的坐标位置或土建施工预留的位置进行就位；设备的地面应水平、平整，在设备的底部与地面接触的平面，应根据设计要求垫隔振层，使设备保持纵向垂直、横向水平；设备的机械、电气连锁装置应处于正常状态，风机与电加热、内外门及内门与外门的连锁等；设备与围护结构连接的接缝，应配合土建施工做好密封处理。
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