外泌体装载着各种免1疫相关分子，通过这些分子来调节免1疫应答。例如，在细胞杀伤性T细胞或者自然杀伤性细胞来源的外泌体上，携带Fas配体、TRAIL、CD40配体等TNF家族蛋白，可诱导靶1细胞凋亡。
有报道称，癌细胞中也可以释放装载着Fas配体或TRAIL等的外泌体，诱导免1疫细胞凋亡，使癌细胞免受免1疫细胞的攻击。一般情况下，TNF家族蛋白以膜结合形式产生，被膜型金属蛋白酶切割后转变为可溶性蛋白。膜结合蛋白主要担负诱导细胞凋亡的功能，但可溶性蛋白的活性较弱。
在透射电镜基础上，用外泌体标记蛋白对外泌体进行免1疫标记，利用胶体金标记出外泌体表面的特定抗原的位置。结合透射电镜形态学定性的特点，同时确定外泌体标记蛋白的位置。这样同时从形态学及免1疫学原理上验证外泌体。这样数据结果中既可以获得经典形态的外泌体，又可以定性及定位外泌体表面的标志蛋白。这样具有更充分的说服力。
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