如果船舶在营运过程中安排人工清洗油舱，船长应首先考虑到人员进入密闭舱室的安全问题。提前预订添加剂，并确保计划执行燃油舱清洁的轮机长和轮机员知道如何正确使用添加剂。与租家及时沟通，轮船清洗油舱，为聘请工程队清洗合理安排好船期。进入程序必须遵守国际海事组织第A.1050(27)号决议关于《进入船上密闭舱室的建议案》中的安全措施。
清洗过程中也可以同时检查油舱结构、加热系统以及进行压力测试等。清洗方法所用时间是基于航运实践的经验总结，淮北油舱清洗，并不一定适用于每一船舶。IMO也表示，船舶为满足0.50%m/m含硫量上限而备舱所需的时间和工作量难以预估。在2020年1月1日之前，大部分使用HSFO的船队都不可能在很短的时间内进行干船坞检查、清洁。
如果雇佣工程队轮流清洗，船油舱清洗，则每个油舱至少需要2天，同样为周全考虑，好为每个油舱预留出4天时间。一些航运公司在更换使用燃油舱之前会使用化学添加剂进行清洗。实践证明，这是减少清洗油舱非常有效和经济的方式之一。如果船舶在船坞中仅仅清洗了燃油舱，而没有进行管路冲洗，船舶在接收完合规燃油后仍需要2-5天的时间来冲洗燃油系统管路以达到排放要求。
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