船舶进入船坞进行燃油舱清洗所需要的时间因船而异，油舱清洗价格，但一般来说每个燃油舱清洗的平均耗时为2-4天，再加之对船舶燃油系统管路的冲洗。目前大多数船舶使用的仍是高粘度高硫燃料油(HSFO)，此类燃料油会粘附在油舱内壁上，非常难清洁。提前预约船舶坞期，并应考虑船坞繁忙可能存在的压港现象；慎重安排船员自行清洗，应考虑到船员人手不足、疲劳、通风不足和安全问题。
油舱在清洗之前需要排空，淮北油舱清洗，这段时间也应计算在内，且冲洗船上燃油系统管路还需要1-2天。油舱清洗后的残余物应通过正确方式排放或由港口接收设施处理。残留物通常也会凝固并沉淀在燃油系统的各个部分，包括管道、沉淀柜和日用柜。清洗方法所用时间是基于航运实践的经验总结，机油舱清洗，并不一定适用于每一船舶。IMO也表示，船舶为满足0.50%m/m含硫量上限而备舱所需的时间和工作量难以预估。
限硫令生效后，预计大多数船舶将使用含硫量低于0.50%的馏分燃料，柴油舱清洗，但是目前大部分船舶一直在使用高粘度高硫燃料油。除人工清洗外，船舶还可以通过添加剂逐步清洗HSFO油舱和燃料系统中的沉淀物和沥青质污泥，这种方法相对安全且简单，可以为船舶节省很多时间成本和经济成本。冲洗船舱的灰土、船舱垫尘、油污等产生的废水，该类废水属于含油废水或含有一定毒性液体的污水。
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