石英套管外壁的清洗工作是运行和维修的关键。当污水流经紫外线消毒器时，其中有许多无机杂质会沉淀、粘附在套管外壁上。尤其当污水中有机物含量较高时更容易形成污垢膜，而且微生物容易生长形成生物膜，这些都会抑制紫外线的透射，影响消毒效果。因此，必须根据不同的水质采用合理的防结垢措施和清洗装置，开发研制具有自动清洗功能的紫外线消毒器。
大多数紫外线装置利用传统的低压紫外灯技术，也有一些大型水厂采用低压高强度紫外灯系统和中压高强度紫外灯系统，由于产生高强度的紫外线可能使灯管数量减少90%以上，紫外线杀菌灯，从而缩小了占地面积，紫外线杀菌灯的作用，节约了安装和维修费用，并且使紫外线消毒法对水质较差的出水也适用。使用事宜编辑由于紫外线能够穿透细胞使其，因此用紫外线消毒时要注意不能直接照射到人的皮肤
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